If you do not find what you're looking for, you can use more accurate words.
قُيمت التفاعلات بين المواد الدخيلة الحيوية وميكروبيوم المضيف بشكل أساسي من خلال إجراء تجارب على النماذج حيوانية في المختبر، إذ تصعب محاكاة الأمعاء البشرية الطبيعية. بشكل عام، يكون نمط المستعمرات البكتيرية ذاتها في الحيوانات المختلفة، من ناحية درجة الحموضة وعدد الكائنات الحية الدقيقة اللذين يزدادان تدريجيًا من الأمعاء الدقيقة باتجاه الموصل اللفائفي الأعوري للأمعاء الغليظة. تُعد الجرذان الخالية من الجراثيم والمستعمرة بالمواد البرازية البشرية المعيار الذهبي في المحاكاة الحيوانية للبيئة الميكروبية المعوية. ومع ذلك، قد تختلف الفعالية الإنزيمية اختلافًا كبيرًا بين الكائنات الحية.
تمثل الميكروبات الموجودة في عينات البراز البشري إلى حد ما الميكروبات المعوية، وهي تُستخدم بشكل متكرر في المزارع المختبرية. طُورت مجموعة متنوعة من تقنيات النمذجة الميكروبية في المختبر. تتضمن زراعة الوجيبة الساكنة فرش البكتيريا دون إعادة ملء الوسط على فترات منتظمة. تسمح أنظمة الزرع شبه المستمر بإضافة الوسط دون عرقلة نمو البكتيريا، وتشمل إمكانية التحكم بدرجة الحموضة. يشابه نظام الزرع المستمر نظام الأمعاء بدرجة أكبر، لأنه يجدد وسط الزرع ويزيله بشكل مستمر. ينجز جهاز محاكاة النظام الميكروبي المعوي البشري (إس إتش آي إم إي) عملية نمذجة الأمعاء الدقيقة والغليظة من خلال استخدام مفاعل من خمس مراحل، ويتضمن العديد من المنافذ من أجل المراقبة المستمرة لدرجة الحموضة والحجم. في الآونة الأخيرة، حسّن الباحثون جهاز «إس إتش آي إم إي» من خلال إضافة موجة تمعجية يجري التحكم بها بواسطة الكمبيوتر لتدوير الكيموس في جميع أنحاء الجهاز. منحت هذه التقنيات الباحثين تحكمًا دقيقًا ببيئة الزراعة، ما سهل اكتشاف التفاعلات بين المواد الدخيلة الحيوية والميكروبات.