books peptide sequence tag
If you do not find what you're looking for, you can use more accurate words.
علامة تسلسل الببتيد (Info)
علامة تسلسل الببتيد هي جزء من المعلومات المتعلقة بالببتيد والتي يتم الحصول عليها بإستخدام مطياف الكتلة الترادفية والتي تستخدم لتحديد هذا الببتيد في قاعدة بيانات البروتين.
قياس الطيف الكتلي
بشكل عام، يمكن تحديد الببتيدات عن طريق تجزئتها في مطياف الكتلة. على سبيل المثال، خلال تحفيز التصادم تتفكك الببتيدات المتصادمة مع الغاز داخل مطياف الكتلة و تنكسر إلى قطع في الروابط الببتيدية. و تحتوي أيونات القطع الناتجة على ما يسمى ( y-ions & b-ions ) و تمتلك كتل مختلفة اعتمادا على الكتلة المتبقية من الأحماض الأمينية ذات الصلة. وهكذا، يحتوي طيف الكتلة الترادفية على معلومات جزئية حول تسلسل الحمض الأميني للبتيد. يستخدم نهج علامة تسلسل الببتيد الذي طوره ماتياس ويليم و ماتياس مان في مختبر البيولوجيا الجزيئية الأوروبي ، الذي يستخدم هذه المعلومات ( المعلومات المتعلقة بعلامة تسلسل الببتيد ) لتحديد الببتيد في قاعدة البيانات. باختصار، يتم استخلاص إثنين من الكتل من الطيف من أجل الحصول على علامة تسلسل الببتيد. و تعتبر علامة تسلسل الببتيد تعرفة فريدة و مميزة لكل ببتيد و يمكن إستخدامها للعثور عليه في قاعدة بيانات تحتوي على جميع الببتيدات الممكنة.
رموز قطع الببتيد
و قد تم تطوير الرموز التي تشير إلى قطع الببتيد الناشئة من طيف الكتلة الترادفية. يشار إلى أيونات الببتيد بواسطة (a,b,c) إذا بقيت الشحنة على N-terminus و بواسطة ( x,y,z ) عند الحفاظ على الشحنة على C-terminus. و يشير المخطط إلى عدد الأحماض الأمينية المتبقية في كل جزء. و تشير الرموز العلوية إلى عدد البروتونات أو الهيدروجينات المضافة إلى الجزء لشكيل الأيون الملاحظ. على سبيل المثال، يشير y"" إلى أيون مشحون بشحنة فردية مماثل للببتيد البروتوني، بينما 2+( y""") إلى أيون مشحون بشحنة مضاعفة مماثل للببتيد البوتوني المزدوج.
روابط إضافية
- PeptideSearch Program
- SPIDER: Sequence Tag Based Search Tool
- Peptide sequence tag tutorial
