يوجد عدد من المعالم الأثرية في قلعة بعلبك إلى ما يلي:
- معبد بعل مرقد جوبيتير: يُعرف هذا المعبد بالقلعة، ويقع إلى جانبه معبد دير القلعة (معبد دير مارحنا)، ويُعتبر المعبد من أهم الآثار المُكتشفة في منطقة بيت مري، وتتميز حجارتها بالضخامة التي تجعل منها شبيهة بأعمدة وحجارة قلعة بعلبك.
- معبد باخوس: وهو معبد أصغر حجماً من معبد جوبيتير، ويعود تاريخ بناؤه إلى القرن الثاني الميلادي، ولعل أهم ما يُميز هذا المعبد قدرته في الحفاظ على معالمه رغم مرور الزمن، حيث يتألف من بوابة عملاقة، ويصل ارتفاعها إلى 13 متر، وعرضها حوالي 6 متر، ويقع على منصة ذات ارتفاع 5 متر.
- معبد فينوس: يقع خارج القلعة، وداخل الحرم القدسي، وكانت زخرفته على شكل صفين من الأعمدة.
- تحتوي مدينة بعلبك على عدد من المواقع الإسلاميّة المهمة، ومنها: مقام السيدة خولة، والجامع الكبير، وجامع النهر، وجامع الحنابلة، وجامع الصاغة، والمدرسة النوريّة.
Source: mawdoo3.com