فيما يلي ذكر لسلبيات الاتحاد الكونفدرالي:
- ضعف في السلطة المركزية للدولة وذلك لأنّ القرارات تأتي بالإجماع من الاتحاد نفسه.
- عدم قدرة السلطة المركزية على فرض الضرائب بشكل مناسب مما يؤثر على إيرادات الدولة المالية.
- وجود بعض الصراعات بين دول الاتحاد الكونفدرالي.
- احتمالية عدم استدامة الاتحاد وذلك كونها تعتبر أحد أكثر أشكال اللامركزية.
Source: mawdoo3.com