كتب quantitative proteomics
اذا لم تجد ما تبحث عنه يمكنك استخدام كلمات أكثر دقة.
البروتيوميات الكمية (معلومة)
يستخدم البروتين الكمي لتحديد الكمية النسبية أو المطلقة من البروتينات في العينة. تعتمد عدة طرق بروتومية كميّة على قياس الطيف الكتلي جنباً إلى جنب. وقد أصبح MS /MS إجراءً معيارياً لجلاء هيكلي للجزيئات الحيوية المعقدة.
طريقة واحدة تستخدم عادة للبروتيوميات الكمية هو وضع العلامات التساوية. علامة الـ Isobaric وسم يتيح تحديد وتكميم البروتينات في وقت واحد من عينات متعددة في تحليل واحد. ولتحديد كمية البروتينات، تحمل الببتيدات علامات كيميائية لها نفس الهيكل والكتلة الاسمية، ولكنها تختلف في توزيع النظائر الثقيلة في بنيتها. هذه العلامات، التي يشار إليها عادة باسم العلامات كتلة جنبا إلى جنب، مصممة بحيث يتم شق العلامة الشامل في منطقة رابط محددة على أعلى الطاقة الناجمة عن تفكك الاصطدام (HCD) خلال قياس الطيف الشامل جنبا إلى جنب تسفر عن أيونات مراسل من الجماهير المختلفة. يتم إنجاز كمية البروتين من خلال مقارنة شدة أيونات المراسل في أطياف MS/MS. اثنين من العلامات isobaric المتاحة تجاريا هي iTRAQ والكواشف TMT.
علامات متساوية الضغط للكمية النسبية والمطلقة (iTRAQ)
علامة تساوي الضغط بين الزوارق للكمية النسبية والمطلقة (iTRAQ) هي كاشف لقياس الطيف الكتلي المرادف الذي يستخدم لتحديد كمية البروتينات من مصادر مختلفة في تجربة واحدة. ويستخدم النظائر المستقرة الجزيئات المسماة التي يمكن أن تشكل رابطة تعايشية مع N-terminus وسلسلة جانبية من البروتينات. وتستخدم الكواشف iTRAQ لتسمية الببتيدات من عينات مختلفة التي يتم تجميعها وتحليلها بواسطة الكروماتوغرافيا السائلة وقياس الطيف الكتلي جنبا إلى جنب. تجزئة العلامة المرفقة يولد أيون مراسل كتلة الجزيئية منخفضة التي يمكن استخدامها لتحديد كمية نسبيا الببتيدات والبروتينات التي نشأت منها.
علامة كتلة الترادف (TMT)
علامة كتلة الترادف (TMT) هو تسمية كيميائية العلامة كتلة متساوية الضغط المستخدمة لتحديد الكم البروتين وتحديد. [54] تحتوي العلامات على أربع مناطق: المراسل الشامل، رابط قابل للشق، تطبيع الكتلة، ومجموعة البروتين التفاعلي. يمكن استخدام الكواشف TMT لتحليل 2 إلى 11 عينة ببتيد مختلفة في وقت واحد أعدت من الخلايا والأنسجة أو السوائل البيولوجية. ثلاثة أنواع من الكواشف TMT متوفرة مع عمليات إعادة تنشيط كيميائية مختلفة: (1) مجموعة وظيفية NHS استر التفاعلية لوضع العلامات الأمينات الأولية (TMTduplex، TMTsixplex، TMT10plex بالإضافة TMT11-131C)، (2) مجموعة وظيفية iodoacetyl التفاعلية لوضع العلامات على السلفهيدريل مجانا (iodoTMT) و (3) مجموعة وظيفية ألكوسيامين التفاعلية لوضع العلامات من الكربونيات (aminoxyTMT).
