كتب مصادر العائلات البروتينية
اذا لم تجد ما تبحث عنه يمكنك استخدام كلمات أكثر دقة.
مصادر العائلات البروتينية (معلومة)
هنالك العديد من قواعد البيانيات البيولوجية التي تسجل أمثلة على العائلات البروتينية وتسمح للمستخدم بمعرفة إذا ما تم التعرف على بروتينات جديدة تنتمي إلى عائلة معروفة.
وهذه بعض الأمثلة:
• Pfam: قاعدة بيانات العائلات البروتينية المرتبة والـ HMMs.
• PROSITE: قاعدة بيانات لنطاقات البروتين والعائلات و المواقع الوظيفية على البروتين.
• PIRSF: نظام لتصنيف العائلات الخارقة.
• PASS2: ترتيب البروتينات إلى عائلات خارقة بناءا على التركيب (v2 - PASS2@NCBS).
• العائلة الخارقة (SUPERFAMILY) : مكتبة للـHMMS التي تمثل العائلات الخارقة وقاعدة البيانات للعائلات الخارقة والعائلات البروتينية والتي تم ترقيمها بناءا على التي تم اجاد تسلسل أحماضها الأمينية كاملا من الكائنات التي تنتجها.
• SCOP و CATH : تصنيف تركيب البروتينات إلى عائلات خارقة، وعائلات، ونطاقات متشابهة.
قواعد بيانات مشابه تتبع لوغاريثمية اخرى لتصنيف البروتينات، مثل:
- • BLAST: تبحث في التشابه في تسلسل القواعد النيتروجينية في الجين المنتج للبروتين
- • BLASTp: تبحث في التشابه في تسلسل الأحماض الأمينية المكونة للبروتين
- • OrthoFinder: طريقة سريعة ودقيقة لايجاد البروتينات المتجمعة في عائلة واحدة (مجموعة الأورثو –orthogroups-)
