كتب بنية ثانوية
اذا لم تجد ما تبحث عنه يمكنك استخدام كلمات أكثر دقة.
بنية ثانوية (معلومة)
البنية الثانوية للرنا هي مجموع الروابط البينية داخل جزيء مفرد السلسلة. يُحدِث مجموع الروابط بنيةً هيكلةً خاصةً تتكون من مناطق لولبية (جذوع مترابطة قاعديا) ومناطق غير مترابطة (حلقات). وعليه البنية الثانوية هي الهيكلة التي تحدثها الروابط الداخلية للجزيء.
يَحدُث تشكل البُنى الثانوية في جزيء رنا بتواجد مناطق تحتوي تسلسلات متناظرة يمكنها الترابط لتشكيل بنية لولبية مزدوجة محلية. على سبيل المثال إذا احتوى الرنا على التسلسلين --GUGCCACG------CGUGGCAC-- فإن بإمكانهما تشكيل تسلسل متناظر تكون فيه نوكليوتيدات التسلسل الثاني مكملة للأول، فبعد عكس اتجاه أحدهما يمكن أن يترابط التسلسلان عبر توازٍ متضاد لتشكيل منطقة محلية مزدوجة تسمى جذع وبين هذين التسلسلين تتكون "حلقة" وهذا ما يسمى بالحلقة الجذعية أو بنية دبوس الشعر.
في جزيئات الرنا الطويلة جدا يمكن أن تتواجد بنُى أكثر تعقيدا تنتج عن ترابط عدة مواقع متكاملة أو متناظرة. حسب طريقة تجمع هذه المناطق يمكن أن تنتج بُنى مختلفة ذات جذوع متعددة وأنواع مختلقة من الحلقات تشمل:
- الحلقات الطرفية أو النهائية، وتقع في نهاية الجذع.
- الحلقات الداخلية والتي تحدث وسط الجذع.
- الحلقات المتعددة والتي تحتوي على ثلاث جذوع أو أكثر وتشكل نقاط تفرع في البنية.
- النتوء (bulge) أو الحلقة الجانبية والتي تتشكل على إحدى سلسلتي الجذع فقط. واستمرارية الجذع (اللولب المزدوج) لا تتأثر بشكل عام وتبقى القواعد محزَّمةً بشكل محوري على كلا جانبي النتوء.
لا توجد بنية مستقرة دائمة يتخذها تسلسل رنا معين، بل يمكن لنفس التسلسل اتخاذ العديد من البنى حسب نوع الربيطة التي يترابط معها (بروتين، جزيء صغير...) أو الظروف الفيسيولوجية الكيميائية (قوة أيونية، أس هيدروجيني). يمكن بشكل عام تتبع تشكل أو اندماج بنية الرنا الثانوية بواسطة قياساتٍ مطيافيةٍ فمثلا: امتصاص قواعد الرنا للأشعة فوق البنفسجية يكون أكثر في حالة عدم التطوي وأقل عند التطوي (ظاهرة فرط الكرومية).
