اذا لم تجد ما تبحث عنه يمكنك استخدام كلمات أكثر دقة.
بدأت الحرب مرة أخرى عام 1883، عندما حوصرت السفينة البريطانية نيسيرو في آتشيه، في منطقة لم يكن للهولنديين فيها تأثير يذكر. طلب زعيم محلي فدية من كل من الهولنديين والبريطانيين، وتحت الضغط البريطاني، أجبر الهولنديون على محاولة تحرير البحارة. بعد محاولة هولندية فاشلة لإنقاذ الرهائن، إذ طلبت المساعدة من الزعيم المحلي تيوكو عمر لكنه رفض، غزا الهولنديون مع البريطانيين المنطقة. تخلى السلطان عن الرهائن، وتلقى مبلغًا كبيرًا من المال في المقابل.
أعلن وزير الحرب الهولندي أوغست ويليم فيليب ويتزل مرةً أخرى الحرب المفتوحة على آتشيه، واستمرت الحرب مع نجاح ضئيل، كما حدث سابقًا. في مواجهة عدو متفوق تقنيًا، لجأ الآتشيون إلى حرب العصابات، ولا سيما الفخاخ والكمائن. ردت القوات الهولندية بمحو قرى بأكملها وقتل السجناء والمدنيين على حد سواء. في عام 1884، رد الهولنديون بسحب جميع قواتهم في آتشيه إلى خط محصن حول باندا آتشيه. حاول الهولنديون أيضًا تجنيد القادة المحليين: اشترى الهولنديون عمر المذكور أعلاه بالنقود والأفيون والأسلحة. تلقى عمر لقب بانغليما برانغ بيسار (قائد الحرب العظمى).
بدلاً من ذلك، أطلق عمر على نفسه اسم تيوكو دجوهان بهلوان (جوهان البطولي). في الأول من يناير 1894 تلقى عمر مساعدة هولندية لبناء جيش. ومع ذلك، بعد عامين هاجم عمر الهولنديين بجيشه الجديد، بدلًا من مساعدة الهولنديين في إخضاع آتشيه الداخلية. سُجلت هذه الحادثة في التاريخ الهولندي باسم خيانة توكو عمر. منذ منتصف ثمانينيات القرن التاسع عشر، سيطر العلماء الدينيون على القيادة العسكرية في آتشيه، بما في ذلك تونغكو شيك دي تيرو (محمد سمّان)، الذي نشر مفهوم الحرب المقدسة من خلال المواعظ والنصوص المعروفة باسم الحكايات أو الروايات الشعرية. اعتبر مقاتلو آتشيه أنفسهم شهداء متدينين يقاتلون الغزاة الكافرين. في هذه المرحلة، كانت حرب آتشيه تُستخدم كرمز لمقاومة المسلمين للإمبريالية الغربية.
في 1892 و1893 بقيت آتشيه مستقلة، رغم الجهود الهولندية. كتب الرائد ج. ب. فان هيوتس، قائد عسكري استعماري، سلسلة من المقالات حول آتشيه. دعمه د. كريستيان سنوك هورغرونغي من جامعة ليدن، ثم الخبير الهولندي الرائد في الإسلام. تمكن هورغرونغي من الحصول على ثقة العديد من قادة آتشيه وجمع معلومات استخبارية قيمة للحكومة الهولندية حول أنشطة الحجاج الإندونيسيين. ظلت أعماله سرًا رسميًا لسنوات عديدة. في تحليل هورغرونغي للمجتمع الآتشي، قلل من دور السلطان وجادل بأنه يجب الاهتمام بالقادة والنبلاء الوراثيين، الأولي بلانغ، الذين شعر أنه يمكن الوثوق بهم كمسؤولين محليين. ومع ذلك، جادل بأن الزعماء الدينيين في آتشيه، العلماء، لا يمكن الوثوق بهم أو إقناعهم بالتعاون، ويجب تدميرهم. ضمن سياسة فرق تسد، حث هورغرونغي القيادة الهولندية لتوسيع الهوة القائمة بين النبلاء الآتشيين والزعماء الدينيين.
كان هورغرونغي صديقًا لمفتي باتافيا العربي، حبيب عثمان بن يحيى، الذي أصدر فتوى لدعم الحرب الهولندية ضد آتشيه.
في عام 1894، ساعد البنغولو أو القاضي حسن مصطفى أيضًا في وقف القتال من خلال إصدار فتوى، وطلب من المسلمين الخضوع للحكومة الاستعمارية الهولندية.