اذا لم تجد ما تبحث عنه يمكنك استخدام كلمات أكثر دقة.
تم القبض على ماكين وسُجن في 26 أكتوبر 1967. كان في طلعة التفجير رقم 23 له على فيتنام الشمالية عندما أُسقطت طائرته الإيه-4 سكاي هوك بواسطة صاروخ فوق هانوي. كُسرت ذراعي ماكين وساقه عندما قُذفَ من الطائرة، وغرق تقريباً بعد أن هبط بالمظلة في بحيرة تروك باخ. سحبه بعض الفيتناميين الشماليين إلى الشاطئ، ثم سَحق آخرون كتفه بعقب بندقية وقاموا بطعنه. ثم نُقل ماكين إلى السجن الرئيسي في هانوي، الملقب بـ "هانوي هيلتون".
على الرغم من إصابة ماكين بجروح خطيرة، إلا أن آسريه رفضوا معالجته. قاموا بضربه واستجوابه للحصول على معلومات، ولم يحصل على الرعاية الطبية إلا عندما اكتشف الفيتناميون الشماليون أن والده كان أميرالًا. وضعه كسجين حرب تصدر الصفحات الأولى في الصحف الأمريكية الكبرى.
أمضى ماكين ستة أسابيع في المستشفى، حيث تلقى رعاية هامشية. فقد خلالها 23 كيلوغرام، وتحول شعره الرمادي إلى اللون الأبيض. تم إرسال ماكين إلى مخيم آخر في ضواحي هانوي. في ديسمبر 1967، وُضع ماكين في زنزانة مع أمريكيين آخرين لم يتوقعوا أن يعيش لأكثر من أسبوع. في مارس 1968، تم وضع ماكين في الحبس الانفرادي حيث بقي لمدة عامين.
في منتصف عام 1968 تم تعيين والده جون س ماكين جونيور قائداً لجميع القوات الأمريكية في حرب فيتنام، وقدم الفيتناميون الشماليون عرضاً بالإفراج المبكر عن ماكين وذلك لأنهم أرادوا الظهور بالمظهر الرحيم للحصول على مكاسب سياسية وأيضاً لجعل بقية أسرى الحرب يرون بأن السجناء من أبناء النخبة يعاملون بشكل تفضيلي عن بقية السجناء. رفض ماكين العودة إلى الوطن إلا إذا تم إطلاق سراح بقية السجناء قبله. مثل هذا الإفراج تم حظره حسب تفسير الأسرى لمدونة قواعد السلوك العسكرية التي نصت عليها المادة الثالثة: قالب:اقتباس مضمن. لمنع الفيتنامين من استخدام السجناء للدعاية، وافق الضباط على إطلاق سراحهم في الترتيب الذي تم القبض عليهم فيه.
ابتداءً من أغسطس 1968، تعرض ماكين لبرنامج تعذيب شديد. كان مقيداً وضرب كل ساعتين. وقعت هذه العقوبة في نفس الوقت الذي كان يعاني من الحرارة والزحار. بسبب كثرة التعذيب وصل ماكين ل"مرحلة الانتحار"، لكن محاولاته أُحبطت من قِبل الحراس. في نهاية المطاف قدم ماكين "اعتراف" مناهض للدعاية الأمريكية. شعر دائمًا بأن تصريحه كان مشينًا، ولكن كتب في وقت لاحق، قالب:اقتباس مضمن تعرض العديد من أسرى الولايات المتحدة للتعذيب وسوء المعاملة من أجل انتزاع "اعترافات" وبيانات للدعاية؛ فعلياً لعبت هذه الاعترافات في نهاية المطاف دوراً مثمراُ لصالح الفيتنامين. تلقى ماكين من ضربتين أو ثلاثة ضربات أسبوعياً بسبب استمراره برفض التوقيع على تصريحات إضافية.
رفض ماكين الالتقاء بمختلف الجماعات المناهضة للحرب التي تسعى إلى السلام في هانوي، راغباً في عدم منحهم ولا الفيتناميين الشماليين نصراً دعائياً. منذ أواخر عام 1969 تحسن علاج ماكين والعديد من أسرى الحرب الآخرين، في حين استمر ماكين في مقاومة إدارة المخيم. كان ماكين وسجناء آخرون قد رحبوا بحملة "تفجيرات عيد الميلاد" الأمريكية في ديسمبر / كانون الأول عام 1972، واعتبروها إجراءً قوياً لدفع فيتنام الشمالية إلى التسوية.
بقي ماكين أسير حرب في فيتنام الشمالية لمدة خمس سنوات ونصف حتى إطلاق سراحه في 14 مارس 1973. تركته إصاباته في زمن الحرب غير قادر على رفع ذراعيه فوق رأسه. بعد الحرب عاد ماكين إلى موقع الاعتقال مع زوجته سيندي وعائلته في عدة مناسبات لمحاولة التصالح مع ما حدث له هناك أثناء اعتقاله.