تضم الجامعة تسع كليات ومراكز للبحث والتدريب بالإضافة الي مركزٍ صحيٍ وعدد من الوحدات الصحية التي تقدم الرعاية الصحية للطلاب والعاملين وأسرهم. وهناك خمسة مجمعات تتكون منها جامعة سنار هي:
- (مجمع مدينة أبونعامة) ويقع جنوب ولاية سنار علي مسافة 55 كيلومتر من مدينة سنجة حاضرة الولاية. يضم هذا المجمع مقر إدارة الجامعة وكلية الزراعة وكلية الدراسات العليا والبحث العلمي وعمادة المكتبات ومساكن هيئة التدريس والموظفين وداخليات الطلاب والطالبات ومركز صحي ومركز توزي للتدريب الفني للآلات الزراعية ومزرعة الجامعة بأبي نعامة ومزرعة مركز توزي.
- (مجمع مدينة سنار) ويضم كلية الطب والعلوم الصحية وكلية الهندسة وكلية العلوم الإسلامية والعربية وكلية الاقتصاد والعلوم الإدراية ومركز التدريب والتنمية البشرية ومركز السلطنة الزرقاء للدراسات السودانية والبحوث ومكاتب إدارة الجامعة الفرعية وعمادة الطلاب واستراحات وسكن الطلاب والطالبات.
- (مجمع مدينة السوكي) ويضم كلية الموارد الطبيعية والدراسات البيئية وسكن هيئة التدريس.
- (مجمع مدينة سنجة) ويقع في حاضرة الولاية ويضم كلية التربية واستراحات هيئة التدريس وسكن الطلاب والطالبات والوحدة الصحية.
- (مجمع مدينة أبوحجار) ويضم رئاسة كلية المجتمع ولها عدة فروع منتشرة بالولاية.
المصدر: wikipedia.org