كانت للشيخ جعفر اهتمامات بالنشر ومساهمات في التأليف. ومن أبرز العناوين التي نشر أو شارك بتأليفها:
- كتاب (خلاصة الوفا بأخبار دار المصطفى)، الذي وضعه مؤرخ المدينة المنورة نور الدين علي بن عبد الله السمهودي سنة 891هـ. طبعت طبعته الأولى ببولاق سنة 1358هـ، 1938م. وطبعه الشيخ جعفر ثانية مع تعليق لوالده الشيخ إبراهيم فقيه سنة 1367هـ، 1947م. ثم زاد عليه في طبعة ثالثة على نفقته أيضاً سنة 1403هـ، 1983م، مدعمة بالصور والرسوم التوضيحية.
- كتاب (ذكريات طيبة، وبحوث حول أسرار الحج والزيارة). نشره إبان ممارسته عمله بمكتبة الفقية بباب الرحمة. وهو كتاب للأستاذ هاشم دفتر دار، يتضمن مباحث عن السيرة النبوية، وفضل دار الهجرة ومسجدها النبوي، ومساجدها المباركة الأخرى كقباء والقبلتين والجمعة والفضيخ. وعن مناسك الحج والعمرة، ومباحث أخرى.
- كما ألف كتيباً عن آداب زيارة المسجد النبوي الشريف طبع سنة 1368هـ، 1948م.
- ألف كتاباً حول توسعة الحرم النبوي الشريف بالاشتراك مع الأستاذ هاشم دفتر دار، وضم الكتاب فصولاً عن مساجد طيبة الأخرى. كما تطرق الكتاب للمشروعات التنموية التي تمت في المدينة المنورة في تلك الفترة.
- طبع على نفقته تصاميماً وخرائط لمراحل توسعة المسجد المدني بدءاً من العهد النبوي المبارك وحتى التوسعة المجيدية. ثم أعاد طباعتها مضمناً إياها التوسعة السعودية الأولى سنة 1391هـ مع شروحات للمساحات المتعاقبة وتواريخها.
- أعد تقريراً موثقاً بوزارة المعارف عن التعليم في المدينة النبوية في القرن الرابع عشر.
- له تراجم لأدباء وشعراء مؤرخي المدينة المنورة، وأبحاث حول آثارها مواقعها التاريخية المندثرة خطها بيده ويرجى أن تنشر قريباً.
المصدر: wikipedia.org